前，一个很小的势力，由于想要收集古代医方，撰写一部古往今来第一中医秘方，所以便成立药王谷，他们的初衷是以发展中医为宗旨。当时的药王谷并不强，而且由于他们建立门派的宗旨不同，所以没遭受到其他大门派的排斥以及灭杀。
可是在一次意外中，药王谷祖师发现上古时期留下来的武学，于是暗中修炼，表面上，药王谷的宗旨是收集撰写一步神奇药书，而暗中，则是想要超越所有的门派，想要统治整个华夏国的武林。
由于做得很隐蔽，很机密，所有没被人发现。后来，当药王谷崛起，威胁到当时那些大门派。而那些大门派想要镇压药王谷时，已经无能为力。
到南宋后期，很多大门派们为了挽救华夏，纷纷参加了崖山战役。只是很遗憾，崖山战役失败，无数门派也遭受到灭顶之灾，而药王谷当时的谷主很聪明，他选择隐世不出。坐视崖山之战的成败，坐视华夏灭亡，当时的药王谷谷主，一心只想发展本门的实力，不在意华夏的成败。
当时在崖山之战前，药王谷虽然已经极其强盛，但不是唯一最强的门派，也不是天下无敌的门派。只是在那一场的战役中，由于很多大门派们纷纷的灭亡，所以成就了药王谷独一无二的强盛，没有哪个门派能与之抗衡，成为名副其实的第一。
崖山战役，是华夏国有史以来最惨烈的一场战役，但凡是是有血性的华夏人都不会坐视这个民族的存亡。
当时加入这次的战役的门派，包括少林，峨眉，昆仑，崆峒等等，这些顶尖级的门派都参加了。但很遗憾，虽然有无数武林人士的加入，可还是没能挽救南宋的灭亡。
而药王谷的谷主，则是选择明哲保身，事后不但毫发无损，而且地位势力一日千里，取代了所有门派的地位，成为了真正的霸主。
之后进入了明朝，又迎来了明朝与满清的战役，药王谷再次选择避乱，保存自身的实力。
后来又经历乌龟小岛国进攻华夏，药王谷还是选择隐世不出，一次次保
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